Sayfalar

dijital patoloji etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster
dijital patoloji etiketine sahip kayıtlar gösteriliyor. Tüm kayıtları göster

2 Mart 2025 Pazar

dijital patolojide sınır sorunları

Patoloji ile ilgilenen yapay zeka firmaları müşteri çekmek için "clickbait" kullanmaya da başladılar.

Gen profilleme, sanal immünohistokimya gibi araştırma seviyesindeki modelleri "ürün" adı altında satmalarına alışmıştık. "QuPath çok da özellikli bir program değil" diye kendi viewerını öven yazılımcılara da heves kırmamak için şefkatle davrandıydım geçenlerde.

En son, "artık patolog olmadan da kendi Ki67 skorunuzu kendiniz değerlendirin" kısmına geldik. FISH ile tümör dışı alanı değerlendirmekte ısrar eden meslektaşlarımızdan sonra, şimdi de "home made" modeller ile tedaviye yön verici belirteçlerin "branş dışı hekimler ve hatta hastalar tarafından kullanılabilmesi", "tanının demokratikleşmesi", "hasta sağaltımının iyileştirilmesi" gibi kavramların çorbası ile karşılaştık. 

"Mümkün", "vaki", "had", "bilgi ve irfan nüansı" konularında çalıştay yapayım en iyisi.


28 Ağustos 2021 Cumartesi

Adım Adım Memorial Patoloji - Prof. Dr. İlknur Türkmen

Adım Adım Memorial Patoloji - Prof. Dr. İlknur Türkmen https://youtu.be/HYTqkBAHp_I
#memorialpatoloji #memorialsaglik #patoloji yenilikleri, patoloji raporlarının hazırlık aşamaları, hastaların en merak ettiği "Patoloji raporları neden geç hazırlanıyor?" sorusuna yanıt 
 

17 Nisan 2018 Salı

Patolog mikroskopa bakarken tümör hücrelerini bulan algoritma, klasik patoloji ile dijital patolojinin birleşimi

Google mikroskopa bakarken tümör hücrelerini eşzamanlı tespit etmeye başlamış :)

Klasik patoloji ile dijital patolojinin birleşimini görüyoruz burada. Patologları bilgisayar başına oturtup, mikroskoptan kopartmaya çalışmak yerine, patologa alışık olduğu şekilde vaka baktırırken, bilgisayarın destek olması sağlanıyor.

American Association for Cancer Research #AACR18 son kongresinde An Augmented Reality Microscope for Real-time Automated Detection of Cancer adlı çalışmalarını sunmuşlar.

Detaylar şu blogda: An Augmented Reality Microscope for Cancer Detection

Detecting cancer in real-time with machine learning

8 Mart 2018 Perşembe

QuPath ve dijital patoloji analizi


Mac OS için .svs dosyalarını açacak program ararken bulmuştum QuPath'ı.
QuPath'ın validasyonu kolon tümörlerinde CD3, CD8, p53 ve PD-L1 skorlaması yanısıra H&E preparatlarındaki tümör-stroma oranı ile yapılmış.
Örnekler TMA üzerinde, kod ile ve otomatik analiz ile skorlanmış.
Önemli bir nokta skorlamalar sağ kalım ile de karşılaştırılmış.



QuPath: Open source software for digital pathology image analysis Scientific Reports volume 7, Article number: 16878 (2017) doi:10.1038/s41598-017-17204-5

QuPath'ın oldukça iyi eğitim dökümanları var: https://github.com/qupath/qupath/wiki

Makaledeki videolar şunlar:

MOESM2_ESM.mov

MOESM3_ESM.mov



Makalenin referans verdiği diğer dijital analiz araçlarının makaleleri ise şunlar: